Kinnikuman: Hoàn Mỹ Thủy Tổ kể về Suguru Kinniku (Kinnikuman) là một siêu anh hùng vụng về, ngốc nghếch, hài hước, người phát hiện ra rằng mình là hoàng tử mất tích của hành tinh Kinniku. Kinnikuman trở lại võ đài trong trận đấu tay ba hoành tráng giữa các phe Công lý, Ác quỷ và Chojin hoàn mỹ, đồng thời hé lộ nguồn gốc của Chojin.